Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALKQ9UM73 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms