Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NWD2Q9ULI1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NWD2Q9ULI1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms