Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND2AQ9ULE3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND2AQ9ULE3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms