Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZNF608Q9ULD9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF608Q9ULD9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF608Q9ULD9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms