Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms