Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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