Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TMOD2Q9NZR1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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