Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC4BQ9NT99 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms