Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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