Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms