Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNA4Q9HCM2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNA4Q9HCM2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms