Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VAT1LQ9HCJ6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms