Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD3Q9H7E2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms