Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms