Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms