Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KATNB1Q9BVA0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms