Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms