Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms