Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms