Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TPD52L3Q96J77 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TPD52L3Q96J77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms