Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms