Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms