Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms