Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms