Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C16orf54Q6UWD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C16orf54Q6UWD8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms