Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A10Q6U841 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms