Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms