Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL35Q6PF15 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms