Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM6Q6P461 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms