Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL1Q5VZK9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms