Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TDRD12Q587J7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms