Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK1Q52WX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms