Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC184Q52MB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC184Q52MB2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms