Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms