Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC96Q2M329 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms