Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms