Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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