Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLFQ16534 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLFQ16534 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLFQ16534 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLFQ16534 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLFQ16534 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLFQ16534 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLFQ16534 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLFQ16534 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms