Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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