Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRADDQ15628 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms