Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms