Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHBQ15464 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHBQ15464 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHBQ15464 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHBQ15464 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms