Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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