Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms