Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGEF6Q15052 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARHGEF6Q15052 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms