Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD4Q14839 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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