Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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