Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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