Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERCC8Q13216 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ERCC8Q13216 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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