Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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